Kamenné varhany jsou skalní výchozy čedičů, případně dalších sopečných vyvřelin (andezitů, tefritů, trachytů, vzácněji fonolitů), tvořené souborem svislých nebo šikmých, obvykle úzkých odlučných sloupců, připomínajících píšťaly varhan. Ke sloupcovité (prizmatické) odlučnosti horniny dochází podle puklin, které se tvoří během postupného smršťování tuhnoucího magmatu.

Termínem kamenné varhany se označuje soubor sloupců orientovaný kolmo ke směru ochlazování, tj. k zemskému povrchu. Sloupce jsou široké od několika do desítek centimetrů a jsou obvykle pěti- nebo šestiúhelníkové, někde souběžné až rovnoběžné, jinde vějířovitě i jinak uspořádané.

Výchozy s odlučnými sloupci jsou odkryty buď přírodními procesy (např. abrazí na mořském pobřeží nebo v údolních zářezech) nebo antropogenní činností, například těžbou kamene (většina lokalit v ČR).